More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0471 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
388 aa  753    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  51.81 
 
 
357 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.94 
 
 
376 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.56 
 
 
368 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.34 
 
 
362 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  46.24 
 
 
373 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27500  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.5 
 
 
355 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  36.25 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
366 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  31.56 
 
 
376 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
341 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
368 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
346 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
589 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
345 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
337 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
349 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.19 
 
 
331 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
325 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
402 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  26.64 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  27.41 
 
 
335 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 
307 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
347 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
466 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
466 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
466 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
323 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
314 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
342 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
323 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.02 
 
 
349 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.46 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.98 
 
 
330 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  29.8 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.57 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.97 
 
 
357 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  25.67 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.37 
 
 
323 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  33.51 
 
 
329 aa  53.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.88 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>