More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0252 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
337 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.96 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.24 
 
 
366 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
354 aa  348  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.29 
 
 
346 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
359 aa  329  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.57 
 
 
345 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.35 
 
 
368 aa  298  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.16 
 
 
331 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
357 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
357 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
357 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 
368 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  43.08 
 
 
376 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.65 
 
 
328 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 
402 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 
350 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  44.27 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 
332 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
361 aa  208  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.93 
 
 
312 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
349 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
589 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
360 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
315 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
321 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
312 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.07 
 
 
357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
323 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
362 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
376 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
307 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
314 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
315 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.27 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  28.97 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
368 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
466 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
466 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
466 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.88 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  25.33 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.11 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.53 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  28.34 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
372 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.39 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.39 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  25.36 
 
 
847 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  29.28 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  33.83 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.87 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  29.83 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
327 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  28.87 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  28.18 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>