204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7932 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
368 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  58.4 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
362 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.36 
 
 
376 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.84 
 
 
388 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  47.81 
 
 
373 aa  311  9e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.72 
 
 
355 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27500  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.35 
 
 
355 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  35.07 
 
 
366 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
589 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
350 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  29.51 
 
 
376 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
315 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
305 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
359 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
366 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
328 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
317 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
346 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
315 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
345 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
347 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.56 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  29.21 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  30.23 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.22 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
310 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
312 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
372 aa  59.7  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
347 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.36 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.96 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
347 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.77 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
332 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  24.85 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.31 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
466 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
746 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
466 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
466 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  31.29 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.73 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  35.57 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.95 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>