293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
331 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.44 
 
 
345 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.29 
 
 
354 aa  331  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.32 
 
 
368 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.02 
 
 
346 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.72 
 
 
341 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.37 
 
 
366 aa  301  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
357 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
357 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
366 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
357 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.76 
 
 
359 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  45.83 
 
 
376 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.63 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.36 
 
 
350 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.31 
 
 
358 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
358 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
337 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
328 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  38.51 
 
 
335 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
349 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
589 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
305 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
317 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
362 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.71 
 
 
357 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
312 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
325 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.58 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
332 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  28.98 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
388 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
347 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  24.58 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.84 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
501 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.71 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.57 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.65 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  26.2 
 
 
847 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  29.79 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.41 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.02 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  30.08 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.37 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3119  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.37 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0293341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.88 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.75 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>