More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0486 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
359 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.18 
 
 
346 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
354 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.78 
 
 
368 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.01 
 
 
341 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
366 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.56 
 
 
368 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 
357 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 
357 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 
357 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  51.92 
 
 
376 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 
366 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.76 
 
 
331 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.35 
 
 
350 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.97 
 
 
328 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 
358 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.59 
 
 
358 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
361 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  41.12 
 
 
335 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
349 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
312 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
317 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
305 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
315 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
315 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
589 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
321 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
388 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.52 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
312 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
376 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
307 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
315 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  30.75 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.48 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  27.78 
 
 
318 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
347 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.4 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
331 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.32 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  30.88 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.98 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  29.89 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  30.88 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  30.88 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  30.88 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  30.88 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.62 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  32.88 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
313 aa  59.7  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
349 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  29.63 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  29.68 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  30.6 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  31.85 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.06 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.37 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.69 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  30.14 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.26 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.63 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  29.63 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>