193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0345 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 358 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  94.4 
 
 		 358 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.21 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.44 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.71 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.73 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.91 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.2 
 
 		 368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.4 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  46.2 
 
 		 376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 		 350 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.35 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  39.44 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 349 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 589 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.89 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  34.53 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  27.5 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.44 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  25.84 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  26.13 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 466 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.63 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 466 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  28.86 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.43 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.22 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.46 
 
 		 355 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  25 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  24.49 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.78 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  25.41 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.92 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  26.02 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  24.86 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  24.41 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  26.13 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  26.13 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  26.13 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.89 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  27.61 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  26.09 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>