129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2723 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  100 
 
 
335 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 
312 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
366 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.99 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.36 
 
 
346 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.87 
 
 
359 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
368 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
345 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
402 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
357 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
357 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
357 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  36.25 
 
 
376 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.78 
 
 
331 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 
358 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
358 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
328 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
361 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
349 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
332 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
589 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
305 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
315 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.73 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.92 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  25.75 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
388 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.22 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  25.26 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  23.71 
 
 
373 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.84 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.04 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  23.9 
 
 
854 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  33.6 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
364 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
329 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  26.96 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  24.26 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  24.26 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>