More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2322 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.69 
 
 
320 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 
318 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
305 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
351 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
347 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
589 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.31 
 
 
354 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
349 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
360 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
349 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.06 
 
 
357 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
354 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
365 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.04 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
359 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
346 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.78 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
366 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
368 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  26.63 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.89 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.6 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  29.49 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  26.25 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107355  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
501 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  28.43 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1958  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
880 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0262576  hitchhiker  0.00141398 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  27.85 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  25.84 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  27.41 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  25.33 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  23.62 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2397  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.83 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  29.29 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  26.11 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>