178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0719 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
350 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
349 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.57 
 
 
354 aa  345  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.58 
 
 
365 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 
351 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.8 
 
 
349 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.83 
 
 
347 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
466 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
466 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.31 
 
 
343 aa  235  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
466 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.35 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.32 
 
 
338 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.83 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
358 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
358 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 
358 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
358 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 
372 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
328 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 
589 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
328 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
328 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
330 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
331 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  29.05 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
305 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
366 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  28.17 
 
 
854 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
314 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.93 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.83 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  25.66 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.93 
 
 
694 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
402 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.93 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  30.59 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
328 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  28.19 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  26.56 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
339 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
322 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  29.97 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  28.69 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.97 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  28.39 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.94 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>