28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11896 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11896  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1367    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.687176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  31.99 
 
 
854 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  25.83 
 
 
708 aa  54.7  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  25.83 
 
 
725 aa  54.7  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.79 
 
 
884 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
318 aa  50.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  37.04 
 
 
297 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.82 
 
 
873 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  45.83 
 
 
303 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  21.4 
 
 
889 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
335 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
276 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  36.61 
 
 
286 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
338 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  26.25 
 
 
791 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 
306 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 
295 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.43 
 
 
240 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 
285 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
335 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
335 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  31.25 
 
 
584 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.47 
 
 
321 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
250 aa  44.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
347 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
326 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 
296 aa  44.3  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
323 aa  43.9  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>