267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0968 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  100 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  56.74 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  29.67 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  27.39 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.91 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  35.33 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  28.5 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  31.43 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  31.74 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  31.07 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  31.14 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  27.88 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  28.02 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  30.54 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  30.38 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  30.54 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  30.54 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  30.54 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  29.94 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  29.59 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  26.52 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  30.95 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.9 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.36 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  27.4 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  28.24 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.71 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.63 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  29.45 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  28.05 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  25.24 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  26.89 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.48 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 530 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  22.48 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.44 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  25.71 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.99 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  28 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  23.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  25.32 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  24.09 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  25.59 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  24.54 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  21.91 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  29.89 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  27.65 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  28.99 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  29.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  26.54 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  26.24 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  22.17 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  26.27 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  27.23 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  30.46 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  22.44 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>