226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0163 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  85.45 
 
 		 223 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.68 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  62.56 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  34.98 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.86 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  35.47 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  35.47 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  34.3 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  34.9 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  32.8 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  32.62 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  34.45 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  28.78 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  33.13 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  33.13 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  33.13 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  33 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.16 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.15 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  32.14 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.48 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  32.51 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  29.07 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  27.15 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  30.4 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  29.61 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  30.41 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  32.83 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.73 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  31.03 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  31.12 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.32 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.12 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.12 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.02 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.84 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  38.4 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  27.7 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  29.38 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.41 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  32.55 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.78 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  30.37 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.54 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  32.68 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  26.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28.14 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  29.65 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.12 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.83 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  45 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  27.44 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.63 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  30.84 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  29.94 
 
 		 294 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  31.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.86 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 309 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.54 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  32.6 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>