More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2414 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  64.84 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  63.93 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  63.68 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.25 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  35.75 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  33.82 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  32.37 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  37.27 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  37.27 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  33.96 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  35.07 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  33.02 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  32.87 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.74 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33.8 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.27 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  33.33 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  31.55 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.65 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  33.33 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  33.33 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.8 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.62 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.99 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.6 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  27.54 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.83 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.83 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  32.69 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.9 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  30.52 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.13 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.01 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.64 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  26.27 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  25.6 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.48 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  32.16 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  28.17 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.9 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  32.68 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.31 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.7 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  26.57 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  26.86 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.51 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  26.58 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  29.91 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.05 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  33.02 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  27.98 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  29.07 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.18 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  30.24 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.18 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.7 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.92 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.05 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>