125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47367 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  100 
 
 		 366 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  62.39 
 
 		 126 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 234 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  33.01 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 		 236 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 235 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 		 233 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 238 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 232 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  34.01 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.34 
 
 		 231 aa  93.6  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.37 
 
 		 233 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.51 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  32.7 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  31.79 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.3 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.32 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  30.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25.17 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.65 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.65 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  29.06 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.36 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.63 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  30.69 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  28.43 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  39.62 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.02 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  30.2 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  25.91 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.75 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  27.54 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  31.03 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  34.55 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  30.08 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.21 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  27.41 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  26.17 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.72 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  31.51 
 
 		 329 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  24.34 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  30.5 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  30.5 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  26.34 
 
 		 257 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.9 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.05 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  29.9 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  29.9 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  30.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 213 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  27.84 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 225 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 212 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  25.81 
 
 		 246 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  25.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  28.45 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.45 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  26.57 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  26.55 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  25.24 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  29.77 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  29.87 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  28.71 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  23.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  28.67 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  23.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.77 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  24.76 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  23.85 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  23.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>