103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49437 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  39.21 
 
 
282 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  34.54 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.34 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.19 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  29.24 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.08 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  30.38 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  28.87 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  29.96 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.96 
 
 
218 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
235 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  27.43 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.2 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  29.18 
 
 
233 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
233 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
215 aa  59.3  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.34 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.91 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  29.38 
 
 
372 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  33.53 
 
 
228 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0239  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000144523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.96 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  28.96 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  28.51 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.75 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  29.73 
 
 
219 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.57 
 
 
227 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.9 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  30.3 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  26.72 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  27.84 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  31.1 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
223 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.36 
 
 
216 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.33 
 
 
210 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.73 
 
 
279 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
212 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.95 
 
 
491 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.95 
 
 
491 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  29.17 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.67 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.61 
 
 
561 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.31 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.75 
 
 
320 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 
321 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
327 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
212 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  26.42 
 
 
334 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  36.31 
 
 
274 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  25.12 
 
 
386 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
211 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.54 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.7 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  29.27 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  28.57 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.72 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2431  methylene-tetrahydromethanopterin dehydrogenase(NAD+/NADP+) (mtdB)  44.87 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.74 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  49.23 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.12 
 
 
500 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.17 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  35.76 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.33 
 
 
494 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6338  predicted protein  24.89 
 
 
214 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0128162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
214 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.38 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  24.71 
 
 
332 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.86 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  28.69 
 
 
500 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.94 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  23.11 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  26.37 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.09 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>