212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1016 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.68 
 
 
234 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.74 
 
 
231 aa  332  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.54 
 
 
236 aa  330  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
235 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.76 
 
 
238 aa  304  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  59.65 
 
 
231 aa  272  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  50.22 
 
 
232 aa  218  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  49.78 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  48.44 
 
 
232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 
232 aa  201  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.26 
 
 
233 aa  195  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  44.93 
 
 
233 aa  187  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
227 aa  118  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.14 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  33.49 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.16 
 
 
216 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  30 
 
 
221 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
219 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  33.01 
 
 
366 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.51 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  32.88 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  30.45 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  29.68 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  29.95 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  30.09 
 
 
228 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.05 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.05 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  43.31 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
213 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  32 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  31.6 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.64 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.8 
 
 
494 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  32.31 
 
 
224 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  29.24 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.64 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.74 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  28.26 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.44 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.6 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.83 
 
 
500 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.84 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  30.86 
 
 
372 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.44 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.95 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.14 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  33 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  28.34 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.15 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  34.36 
 
 
300 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.68 
 
 
491 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  30.97 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  28.26 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.19 
 
 
332 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.68 
 
 
491 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  28.82 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  41.03 
 
 
493 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  36.72 
 
 
500 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  30.26 
 
 
291 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.9 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
296 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  35.71 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  27.95 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.87 
 
 
494 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.81 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.66 
 
 
320 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.84 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.06 
 
 
325 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.71 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  31.75 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 
324 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
320 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  23.66 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.85 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  31.06 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.52 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  25.25 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.14 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.36 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>