185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1972 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  100 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.93 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  64.13 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  62.56 
 
 		 223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  36.27 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.14 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 		 228 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  37.58 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  35.06 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  36.41 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  36.08 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  36.08 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  42.97 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.92 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  32.87 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  31.6 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  31.6 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  31.6 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  31.6 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  34.43 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  26.7 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  29.39 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  28.16 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.57 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  30.97 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  31.28 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.19 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.14 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  26.44 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.37 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  31.25 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  33.65 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  26.57 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  30.14 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  45.57 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.7 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  31.93 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  41.55 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.66 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.23 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  33.58 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  28.29 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.67 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  34.71 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.54 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  25.11 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  26.48 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.27 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  29.07 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.98 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  28.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  33.08 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  29.28 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  23.08 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  25.71 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  26.24 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  25.59 
 
 		 366 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28.48 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>