172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4454 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  54.03 
 
 
210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  40.95 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  40.95 
 
 
207 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  40.87 
 
 
209 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  39.9 
 
 
209 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  34.26 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  34.26 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  34.26 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.81 
 
 
229 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
223 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  35.06 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  34.9 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  26.54 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  32.56 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  28.78 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08271  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  29.88 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  25.32 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.41 
 
 
257 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.64 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  26.63 
 
 
294 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.88 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.3 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.77 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  23.27 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  26.63 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  26.63 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.77 
 
 
291 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.57 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  24.64 
 
 
218 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
272 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  25.82 
 
 
212 aa  52  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  27.36 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.38 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  23.98 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.65 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  24.3 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  23.44 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  25.64 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
268 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  31.82 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  26.04 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.67 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  25.16 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.02 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  24.66 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  24.85 
 
 
293 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.42 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  32.19 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
247 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  27.4 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  30.33 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.01 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  29.61 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  26.47 
 
 
291 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
231 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
227 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
296 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
210 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  25.35 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
249 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  30.84 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.91 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  23.5 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  23.08 
 
 
297 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.7 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>