98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18769 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  41.63 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  41.63 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  38.13 
 
 
257 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.84 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.93 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  31.43 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  31.72 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.69 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.7 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  30.08 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  30.2 
 
 
222 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  27.35 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.92 
 
 
227 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.87 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
225 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  32.43 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  32.43 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  32.43 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  30.08 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  25.62 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  23.79 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.27 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
209 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.45 
 
 
500 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  23.51 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  23.51 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.51 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  35.85 
 
 
312 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
209 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
214 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  29.84 
 
 
231 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  33.33 
 
 
493 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  24.38 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  25.57 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 
494 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  36.36 
 
 
486 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 
494 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.5 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  25.61 
 
 
219 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
231 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
211 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  27.64 
 
 
231 aa  48.9  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  39.39 
 
 
500 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  31.2 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  30.4 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  32.73 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
209 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  32.73 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  30.83 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.78 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  23.87 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  32.56 
 
 
233 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.23 
 
 
291 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
211 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  31.71 
 
 
126 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.71 
 
 
491 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.69 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.42 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.71 
 
 
491 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  32.2 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  30.5 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  29.77 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  27.17 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
232 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.36 
 
 
210 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
223 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  28.97 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  27.54 
 
 
218 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.95 
 
 
229 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  24.5 
 
 
257 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.69 
 
 
291 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>