170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2180 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
214 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
212 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  39.15 
 
 
212 aa  141  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
212 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 
211 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  38.8 
 
 
374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
215 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 
212 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  28.9 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  36.41 
 
 
210 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
223 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
218 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
218 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  31.94 
 
 
216 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.1 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  30.95 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  29.25 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  33.51 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
218 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.87 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
212 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  31.74 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  29.86 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.03 
 
 
211 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  34.87 
 
 
221 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.35 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  28.24 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.09 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.44 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.03 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.19 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  27.19 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  27.19 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  25.56 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  26.24 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  25.56 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.75 
 
 
309 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.33 
 
 
300 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.3 
 
 
288 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  28.71 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.91 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.85 
 
 
321 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  31.12 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.1 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  27.52 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.29 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  28.37 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  25.35 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  23.68 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  26.75 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  24.55 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  24.88 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.15 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  28.74 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  25.47 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>