More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2018 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  74.4 
 
 
293 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  72.01 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  71.58 
 
 
305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  67.58 
 
 
294 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  67.35 
 
 
294 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  54.64 
 
 
295 aa  348  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.87 
 
 
290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  49.12 
 
 
291 aa  287  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  47.35 
 
 
292 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  43.3 
 
 
295 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
293 aa  225  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  65.49 
 
 
146 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  32.3 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
298 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.52 
 
 
291 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.24 
 
 
291 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.74 
 
 
291 aa  99  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.22 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  24.76 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  25.8 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  28.36 
 
 
381 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  27.61 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.24 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  25.55 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  28.29 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.93 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.03 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  28.3 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  26.72 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.65 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.76 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  26.98 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  26.37 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.36 
 
 
216 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  24.6 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  23.65 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.86 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.1 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.86 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.1 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.56 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  28.15 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  26.02 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.02 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  25.2 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  25.82 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.94 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.72 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  25 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  24.18 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.02 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  25.57 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.49 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.97 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  27.16 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.88 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.83 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  24.3 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.74 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.47 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  27.8 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.16 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  24.44 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.81 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.42 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.81 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>