More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0384 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  82.23 
 
 
292 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.53 
 
 
290 aa  318  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  48.07 
 
 
295 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  48.61 
 
 
294 aa  290  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  49.12 
 
 
294 aa  287  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  48.4 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.72 
 
 
294 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  45.96 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  46.18 
 
 
293 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  44.25 
 
 
295 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
293 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  39.13 
 
 
146 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.35 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  30.83 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.73 
 
 
291 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.35 
 
 
291 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.27 
 
 
300 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  25.88 
 
 
343 aa  92  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  25.56 
 
 
357 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.05 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  28.53 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  24.38 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.14 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.59 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.85 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.76 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  27.84 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.12 
 
 
381 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.02 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  25.19 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  26.75 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.13 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.88 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  28.46 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.74 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.09 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.41 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.41 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  23.08 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  25.48 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  32.1 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.48 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25.6 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.36 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  30.32 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  25.6 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.21 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.4 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  27.35 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  29.05 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.15 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  25.72 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.57 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.14 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.21 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  29.49 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  25.3 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.33 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.84 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  28.92 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.24 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.7 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
307 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
307 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.29 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
450 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.71 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.55 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>