164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30690 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  100 
 
 		 391 aa  811    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  44.72 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  43.17 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  44.89 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  44.14 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  44.41 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  43.17 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  43.12 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  40.56 
 
 		 346 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.22 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  41.35 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  41.08 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  41.82 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.52 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  26.69 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  26.37 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  27.13 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.25 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  26.32 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  27.84 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.03 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.2 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  27.69 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  25.67 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  25.1 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  25.96 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.73 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.18 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.17 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  24.74 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  25 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 219 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  29.95 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  24.38 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 270 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  20.91 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  25.71 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  23.81 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  24.68 
 
 		 605 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  21.28 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.15 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.35 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.53 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.02 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 		 215 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.36 
 
 		 252 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  25 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.4 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  24.32 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.26 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  25.11 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.26 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.26 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  31.18 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  29.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  23.01 
 
 		 231 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  25.3 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  24.41 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.56 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  29.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  29.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  25.33 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  29.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  29.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>