More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2237 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  100 
 
 		 305 aa  630  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  74.32 
 
 		 297 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  74.66 
 
 		 294 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  75.34 
 
 		 293 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  71.58 
 
 		 294 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  69.18 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  57.63 
 
 		 295 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.69 
 
 		 290 aa  309  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  47.22 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  48.4 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  43.45 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.72 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  69.5 
 
 		 146 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.96 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.21 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.81 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.41 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  28.62 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.53 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.46 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  27.44 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.67 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  31.44 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.63 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  28.16 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.51 
 
 		 332 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.34 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.45 
 
 		 320 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  26.69 
 
 		 391 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  25.31 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  29.48 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.9 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.47 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  26.34 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.32 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  24.9 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.67 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.2 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.2 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.29 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.37 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.51 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.84 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.31 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  28.16 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.31 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  22.83 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.69 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.43 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25.94 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  27.47 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.34 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  24.91 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  25.94 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.33 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.55 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  22.27 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 		 584 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  25 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.35 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  23.27 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  27.39 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.66 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.6 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.66 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.06 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  23.97 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  27.5 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>