More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0590 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
304 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 
305 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.18 
 
 
308 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 
304 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  31.56 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.88 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  30.51 
 
 
327 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  29.9 
 
 
338 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
338 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
353 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
381 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
320 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
319 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  27.3 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.4 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.32 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  26.03 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  28.03 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  26.97 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  27.99 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  27.66 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  27.99 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  23.69 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
510 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.54 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  29.58 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  34.04 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.98 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.25 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  23.3 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.73 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30.51 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.11 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.44 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.87 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.78 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.03 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  24.9 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.23 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2948  Male sterility domain protein  34.91 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0517571  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.86 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  22.43 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.76 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.13 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  27.18 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  29.95 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  28.78 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.5 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  30 
 
 
512 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.98 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  31.62 
 
 
498 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  27.18 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  34.23 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.54 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.74 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.42 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.04 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.04 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  23.63 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.89 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.22 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>