46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1080 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  45.75 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  38.97 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  37.56 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  38.03 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  33.64 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  40.82 
 
 		 158 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  32.57 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  32.08 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.4 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 324 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  23.88 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 309 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  26.8 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  26.8 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  26.26 
 
 		 359 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.85 
 
 		 309 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  22.17 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  30.28 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.47 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  29.67 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3817  NmrA family protein  27.93 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  25.79 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  26.6 
 
 		 339 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.4 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.83 
 
 		 329 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 376 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 331 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>