244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4424 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  65.75 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.97 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.27 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.11 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  58.18 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  58.85 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.29 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  59.72 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.91 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.3 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.75 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.15 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  50.45 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  47.66 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.03 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.58 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.75 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  57.8 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.29 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  45.02 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.39 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  45.91 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  46.33 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  43.42 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.13 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  38.97 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  34.25 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  35.98 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.02 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.02 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  34.86 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  32.11 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  35.45 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  30.38 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.27 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.39 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  34.39 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  34.39 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 374 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  30.14 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.17 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.04 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.55 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.71 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.31 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  31.72 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  31.96 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.77 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  29.91 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  29.82 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.13 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  28.31 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.57 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  30.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.44 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.68 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  33.64 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  29.41 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.05 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>