More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1645 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  38.98 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  41.84 
 
 		 193 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  34.05 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.21 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  33.77 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  31.49 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  34.04 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.06 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.76 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  35.15 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.74 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 238 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  32.22 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  29.02 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  30.18 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  31 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  31.61 
 
 		 275 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 284 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 274 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  28.71 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.35 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  29.35 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1526  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 281 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  26.81 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 266 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  29.39 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 281 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 306 aa  88.6  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 287 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 289 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>