More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2401 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  50.17 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  48.47 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  41.36 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  41.64 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  41.49 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  38.98 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  37.59 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  38.08 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  32.74 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  37.59 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  29.07 
 
 		 273 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  29.07 
 
 		 273 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  35.9 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  34.62 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  33.67 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  36.49 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  36.3 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  36.39 
 
 		 450 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  33.23 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.38 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  35.93 
 
 		 226 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.87 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  33.44 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  33.44 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  27.69 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  28.02 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  34.32 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  33.45 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  33.12 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  27.18 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.97 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  31.8 
 
 		 288 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  32.14 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.28 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  35.19 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  27.8 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  34.15 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  34.19 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  26.3 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  24.83 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  32.64 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  25.17 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  27.65 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  32.79 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.51 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  27.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  36.1 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  32.37 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  32.39 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  29.87 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  30.59 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  36.25 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  33.88 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.03 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  32.49 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.05 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  31.84 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  33.33 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  31.52 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  28.43 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  31.07 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  31.07 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  30.93 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  33.93 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  30.13 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  33.33 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  34.18 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  28.05 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  35.44 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  35.37 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2150  NmrA family protein  31.98 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0495058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  29.79 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.84 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.65 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.1 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.16 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.59 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  32.67 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  35.27 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  32.89 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.67 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.25 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  31.15 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.33 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.78 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.74 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  36.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.06 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  31.61 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  34.8 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4224  NmrA family protein  32.34 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  32.37 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>