50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2286 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2286  NmrA family protein  100 
 
 		 287 aa  549  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159289  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1172  NmrA family protein  51.92 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  52.84 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9088  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.12 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  32.06 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  32.42 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.18 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  33.59 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.99 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  30 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.55 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.35 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  30.17 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.51 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  31.6 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  28.98 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.81 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.1 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  29.92 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  29.92 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  28.12 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.69 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.69 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.27 
 
 		 584 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.9 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.25 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  27.87 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  26.91 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  30 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  26.45 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  36.7 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.65 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  27.12 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  30.38 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.4 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.06 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.96 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  27.17 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  31.86 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  28.42 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.57 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.23 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  39.76 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  28.39 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.4 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>