More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1468 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  44.9 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  43.06 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  45.21 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  41.55 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  37.46 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  38.98 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  35.82 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  34.72 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  38.52 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  33.88 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  35.82 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  35.19 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  32.65 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  34.88 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  28.71 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  31.71 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.28 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  36.1 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  31.92 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.21 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  33.22 
 
 		 450 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  24.67 
 
 		 345 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  27.67 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  31.53 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  31.53 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  28.76 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  27.53 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  32.16 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  27.99 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30.71 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  35.45 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  38.46 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  32.64 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  29.33 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  34.39 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  30.36 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  35.9 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  29.71 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.41 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  34.14 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.76 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  26.3 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  27.33 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  30.86 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.67 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.88 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  31.51 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.77 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  31.8 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  28.26 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  31.3 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  32.23 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.54 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  33.33 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.13 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  32.69 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  32.69 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  33.54 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.65 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.8 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  32.69 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.85 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.2 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  26.25 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  29.74 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  35.09 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.05 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11740)  23.94 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  25.97 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  50 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  29.82 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.01 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.41 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.64 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.64 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  30.41 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.04 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>