126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0390 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  100 
 
 		 345 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  95.36 
 
 		 345 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  57.23 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.33 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  29.15 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.47 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  27.81 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.81 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  28.15 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  30.46 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  29.62 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.18 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  28.77 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  24.67 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  29.73 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  27.8 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  27.8 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  26.76 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  27.98 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  27.18 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  27.8 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  25.64 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  23.73 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  25.08 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  26.56 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  24.75 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  25.44 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  24.33 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  26.4 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  24.41 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  27.82 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  23.1 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  24.53 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  24.83 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  23.94 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  24.55 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  34.18 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  26.61 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.06 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  21.32 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11740)  23.77 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  35.62 
 
 		 178 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  35.62 
 
 		 178 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  27.37 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  22.89 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.57 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  22.79 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  26.47 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.44 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  26.97 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  32.02 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.29 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.15 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.63 
 
 		 293 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  37.5 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  23.32 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  25.21 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  25.21 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  29.14 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.63 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 295 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  24.15 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  27.13 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.36 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  23.01 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  24.69 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  40.48 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.87 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  42.03 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.51 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  23.39 
 
 		 282 aa  46.2  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.88 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.25 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.47 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.02 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  23.47 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  25.11 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  23.36 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>