183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1080 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  97.78 
 
 		 315 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  97.78 
 
 		 315 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  50.31 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  47.8 
 
 		 316 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  31.78 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  32.26 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  33.33 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  35.14 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  30.84 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  36.02 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  34.13 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  31.73 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  37.36 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  31.86 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  31.75 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  30.22 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  32.55 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  32.46 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  35.2 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  31.03 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.75 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  31.45 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  44.92 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  29.06 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  31.89 
 
 		 450 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  33.08 
 
 		 286 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.89 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  31.49 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  30.13 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.3 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  32.48 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  33.12 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  26.54 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  28.52 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.79 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  28.48 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.48 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  29.51 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.16 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.16 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  27.92 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  29.13 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  25.08 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  25.08 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4850  NmrA family protein  28.37 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.261677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  24.62 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  30.22 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  28.05 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  28.28 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  30.37 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.37 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  28.07 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.31 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.71 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  30.27 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  45.83 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  45.83 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  26.13 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  26.03 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  26.93 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.49 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.39 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  52.7 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.2 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.8 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.84 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  27.13 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  41.43 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  28.74 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  34.27 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  28.4 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  36.07 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  48.65 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  27.23 
 
 		 513 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  36.07 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.17 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  26.32 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.17 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.17 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  29.61 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.58 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  33.57 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  35.25 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  26.34 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  27.24 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.64 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>