69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00760 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.62 
 
 
293 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  28.43 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  29.18 
 
 
297 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  30.29 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  25.82 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  29.58 
 
 
290 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.21 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  25.67 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  26.51 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  29.37 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  26.51 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.05 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  27.7 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.31 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  27.81 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  26.71 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11740)  25.22 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.94 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.75 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  29.04 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.33 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.05 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  23.96 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  26.1 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  25.42 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  25.2 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  25.47 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  23.87 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  25.5 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  22.5 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  22.89 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  43.24 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.95 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  23.45 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.78 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  34.48 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  25.32 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  34.48 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  25.32 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  24.7 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  25.4 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  22.51 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  27.78 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  23.69 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  25.43 
 
 
506 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.83 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.56 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  27.46 
 
 
223 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  25.36 
 
 
357 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25.19 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.59 
 
 
271 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06780  expressed protein  24.44 
 
 
386 aa  45.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  22.5 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  23.53 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  27.91 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  25.31 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  24.9 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  24.64 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.42 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  23.81 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  23.81 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.36 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>