144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3675 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  100 
 
 
315 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  49.69 
 
 
315 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  49.69 
 
 
315 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  49.38 
 
 
315 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  44.76 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  31.66 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  30.63 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.24 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  33.72 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  28.05 
 
 
688 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
324 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  34.19 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  31.72 
 
 
298 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
311 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.96 
 
 
293 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  29.45 
 
 
309 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  30.82 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  32.85 
 
 
290 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  32.6 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  31.7 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  29.49 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 
318 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  27.99 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  29.35 
 
 
286 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  29.63 
 
 
226 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  27.69 
 
 
312 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  29.61 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  29.57 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  30.38 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  28.43 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  29.7 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.35 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  28.15 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  28.16 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  28.74 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  27.15 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.43 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.42 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.51 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.19 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.19 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  26.91 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  25.99 
 
 
364 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  27.3 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  26.29 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  26.59 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  24.23 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  24.45 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.91 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.7 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.1 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.1 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  25.39 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49854  predicted protein  29.91 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.74 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  41.84 
 
 
274 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  25.49 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  41.35 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  25.68 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.19 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  26.17 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  24.15 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.79 
 
 
290 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  25.9 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  25.7 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.23 
 
 
284 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  28.66 
 
 
287 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.2 
 
 
292 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.7 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
327 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  23.53 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  32.73 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.71 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  24.14 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.52 
 
 
209 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5373  NmrA family protein  25.19 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  29.27 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.91 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  28.42 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  25.19 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  25.64 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  39.73 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  39.73 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08168  Nitrogen metabolite repression regulator NmrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59919]  25.28 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0063095  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.54 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  25.91 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.9 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  30.83 
 
 
506 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  39.22 
 
 
273 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
227 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>