More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2282 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  100 
 
 		 319 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  36.48 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  39.93 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  34.88 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  37.5 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  35.92 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  36.15 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  33.87 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  37.5 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  37.54 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6817  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  33.67 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  33.12 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  34.39 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  34.88 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  32.75 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  34.03 
 
 		 226 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  31.99 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  30.38 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  32.17 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  27.73 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  29.06 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  32.67 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.2 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  26.8 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  33.07 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  28.46 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  25.62 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  31.18 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.16 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  51.19 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  51.19 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  27.46 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  27.82 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  26.45 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.28 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.35 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  27.71 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  24.56 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  31.87 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.19 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  27.92 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.52 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  51.95 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.3 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.35 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.1 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  30.8 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  29.66 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  29.66 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.76 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.4 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.17 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.01 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.52 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.95 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  41.1 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  30 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.92 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.5 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  29.91 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  27.54 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.17 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.96 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.59 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.07 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  27.53 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  24.57 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.5 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.83 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.08 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  41.89 
 
 		 605 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.17 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.7 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  28.31 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  28.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  29 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  31.55 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.48 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.04 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  35.45 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  44.59 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46720  predicted protein  39.53 
 
 		 795 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>