41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3206 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  97.11 
 
 		 364 aa  347  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  33.73 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.66 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.51 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  29.66 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  32.87 
 
 		 316 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  45.83 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  45.83 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  45.83 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.32 
 
 		 284 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  28.57 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  35.62 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  35.62 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  35.16 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08954  conserved hypothetical protein  34 
 
 		 480 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 		 334 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.86 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.6 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  34.45 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  39.73 
 
 		 315 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.03 
 
 		 300 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  34.94 
 
 		 506 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.03 
 
 		 316 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  26.75 
 
 		 336 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30.15 
 
 		 288 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.09 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  28.8 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  30.77 
 
 		 280 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  34.78 
 
 		 280 aa  44.3  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  24.83 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  48.39 
 
 		 298 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.29 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  35.53 
 
 		 309 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.48 
 
 		 293 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 314 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>