17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6817 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6817  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  291  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  40.85 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  32.14 
 
 
298 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.58 
 
 
303 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.71 
 
 
300 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.27 
 
 
284 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  29.25 
 
 
300 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  30.4 
 
 
290 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28 
 
 
315 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  29.58 
 
 
305 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  32.26 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  29.69 
 
 
305 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  31.69 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  31.69 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  31.69 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  24.03 
 
 
315 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>