55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4447 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  100 
 
 		 364 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  97.11 
 
 		 178 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  97.11 
 
 		 178 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08954  conserved hypothetical protein  31.31 
 
 		 480 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  31.25 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.61 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  26.24 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  26.33 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  26.8 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  30.32 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  26.74 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  25.79 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  24.28 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  24.74 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  23.78 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  29.37 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.59 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.59 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  24.31 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  23.97 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  22.89 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  25 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  25.86 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  25.52 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  45.83 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  25.99 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.68 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  45.83 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  45.83 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  28.63 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  21.32 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  21.18 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  35.16 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  26.83 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06780  expressed protein  22.04 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  26.77 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  30.5 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  22.65 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  24.84 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  21.85 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.62 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  32.14 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  27.05 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  21.76 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  25.21 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.67 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  24.33 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  27.55 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  28.33 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.17 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>