14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49854 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49854  predicted protein  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  32.5 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  27.06 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.91 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.23 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 355 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.73 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.21 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  24.6 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  24.6 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  29.46 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>