More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2618 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  100 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  73.01 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 285 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  65 
 
 		 285 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  62.99 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  65 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  62.63 
 
 		 283 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  65.02 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  62.94 
 
 		 297 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  62.28 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  66.67 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  60.79 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  60.78 
 
 		 285 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  58.45 
 
 		 286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  58.45 
 
 		 286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  58.45 
 
 		 286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  60.14 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  60.14 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  60.14 
 
 		 286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  59.78 
 
 		 286 aa  311  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  60.36 
 
 		 282 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  59.78 
 
 		 286 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  63.24 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  63.89 
 
 		 297 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  59.06 
 
 		 286 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  60 
 
 		 285 aa  305  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  64.66 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  59.29 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  59.29 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  59.29 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  58.93 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  58.93 
 
 		 282 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  62.68 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  59.23 
 
 		 293 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  59.23 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  55.36 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  61.54 
 
 		 286 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  56.84 
 
 		 281 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  60 
 
 		 288 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  63.08 
 
 		 298 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  57.24 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  58.18 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  55.83 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  55.83 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  62.24 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  56.67 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  56.46 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  52.11 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  50.36 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  50 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  45.42 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  51.46 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  45.94 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  49.1 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  49.82 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  45.42 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.21 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  46.57 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  44.44 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  44.09 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  45.02 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  44.8 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  48.19 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  43.01 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  46.76 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  40.15 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  42.81 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  44.69 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  44.6 
 
 		 284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  33.79 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  40.22 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  38.15 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  35.13 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  37.59 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  35.36 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  37.72 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  38.91 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  34.18 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  35.37 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  34.15 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  38.08 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32.62 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  33.81 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  34.53 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  41.41 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  34.44 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  35.8 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  34.95 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2748  NmrA family protein  35.69 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  33.91 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.03 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  33.57 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.91 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.55 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01841  NmrA-like family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02840)  28.11 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.972262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  32.28 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.65 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>