33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6771 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  100 
 
 
81 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  94.67 
 
 
274 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  94.67 
 
 
274 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  89.33 
 
 
276 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  62.67 
 
 
274 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.62 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  53.62 
 
 
274 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  50 
 
 
281 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  47.3 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  50 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  50.75 
 
 
268 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  47.06 
 
 
279 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  51.39 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
276 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  49.33 
 
 
278 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  45.59 
 
 
279 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  48.48 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  44.12 
 
 
279 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  42.25 
 
 
276 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  41.79 
 
 
285 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  39.39 
 
 
298 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  44.26 
 
 
281 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  46.43 
 
 
279 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  43.55 
 
 
283 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  40.98 
 
 
287 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  43.55 
 
 
277 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  39.71 
 
 
273 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  44.64 
 
 
280 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  47.27 
 
 
278 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  43.33 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
270 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  41.27 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  39.29 
 
 
304 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>