51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0799 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0799  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2520  hypothetical protein  52.28 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.706797  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  41.63 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1440  hypothetical protein  48.08 
 
 		 158 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0173635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.45 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.69 
 
 		 491 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  37.65 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.88 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  26.07 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.33 
 
 		 500 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 314 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  36.59 
 
 		 386 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.62 
 
 		 494 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  34.45 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  60.98 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  21.81 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  22.11 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  38.96 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  37.66 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  31.93 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  21.81 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  21.98 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  21.98 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  21.98 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  21.89 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 331 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  25.41 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  38.82 
 
 		 511 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  29.87 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  35.44 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387082  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  31.51 
 
 		 493 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 331 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  62.5 
 
 		 280 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 		 222 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>