More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1459 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1459  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
318 aa  617  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.812014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  55.17 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  50.61 
 
 
316 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  48.47 
 
 
317 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  42.32 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  42.45 
 
 
302 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  45.17 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  41.19 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  39.63 
 
 
306 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  41.98 
 
 
311 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  41.61 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
301 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.45 
 
 
304 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  38.44 
 
 
312 aa  208  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.92 
 
 
307 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  36.42 
 
 
307 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.51 
 
 
297 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  41.51 
 
 
297 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.19 
 
 
297 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  41.51 
 
 
297 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  41.51 
 
 
297 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  41.19 
 
 
297 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  38.24 
 
 
301 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  38.08 
 
 
306 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  41.51 
 
 
297 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.2 
 
 
306 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  40.75 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  41.19 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  40.75 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.75 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  41.74 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.53 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.88 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  40.69 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.53 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  41.32 
 
 
295 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.96 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  41.43 
 
 
314 aa  198  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  36.99 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  37.07 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  41.46 
 
 
492 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.48 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  38.56 
 
 
297 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  38.24 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  39.88 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  40.19 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  39.88 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  39.88 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  38.24 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  39.62 
 
 
464 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  40.25 
 
 
297 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  44.2 
 
 
299 aa  195  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  36.45 
 
 
302 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.89 
 
 
313 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  38.56 
 
 
297 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  36.65 
 
 
313 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  39.56 
 
 
297 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 
321 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  37.12 
 
 
307 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  42.77 
 
 
301 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
299 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  41.19 
 
 
304 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  35 
 
 
312 aa  185  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  37.89 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  37.58 
 
 
296 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  37.58 
 
 
296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  33.23 
 
 
301 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  33.23 
 
 
301 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
301 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  35.91 
 
 
313 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  39.75 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  32.6 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  33.02 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  33.65 
 
 
303 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  36.25 
 
 
304 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  37.12 
 
 
307 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  38.68 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
297 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  38.68 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.05 
 
 
299 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  38.68 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  32.92 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  35.83 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  34.58 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.6 
 
 
301 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  33.54 
 
 
301 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  33.23 
 
 
301 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  33.54 
 
 
301 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.17 
 
 
297 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  37.27 
 
 
296 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  43.44 
 
 
299 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  35.35 
 
 
294 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  37.46 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  35.56 
 
 
293 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  39.43 
 
 
292 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  37.31 
 
 
373 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  33.44 
 
 
304 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  31.97 
 
 
301 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>