133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1512 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 230 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.93 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  54.71 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.33 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  56.77 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.33 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.78 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  53.6 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.88 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.61 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  49.55 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  39.17 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  54.42 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.9 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.5 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  40.45 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  38.01 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  41.05 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  42.15 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  38.22 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  36.17 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  34.39 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.67 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.65 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.65 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  32.32 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  32.59 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  38.57 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  28.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  28.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  29.44 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  29.31 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  26.99 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.31 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.33 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 270 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.99 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  26.87 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.88 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  29.14 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.23 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.5 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  29.76 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 321 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.15 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 298 aa  52  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.49 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  27.7 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  26.61 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  29.21 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  28.36 
 
 		 366 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  32.35 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 347 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  27.01 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  32.77 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 358 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 		 358 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>