106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5423 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0355329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.04 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  26.72 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  26.72 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  27.13 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.67 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  26.59 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  27.87 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  28.85 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  28.22 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  28.03 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  27.62 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  27.2 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  28.03 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.55 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  27.2 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  28.51 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  30.17 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  28.86 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  27.35 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  29.03 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  30.64 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 296 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  29.03 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  29.1 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  27.69 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  27.39 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  27.39 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  26.7 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  27.46 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  29.17 
 
 		 366 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.14 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  28.38 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  24.49 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  35.06 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  25 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  30.81 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  27.02 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.12 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  27.64 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  23.83 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.05 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.03 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  28.33 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  25.1 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.43 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.257288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  47.83 
 
 		 450 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.41 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  38.61 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  34.31 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.182694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  28.03 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>