206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3812 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 213 aa  423  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  76.06 
 
 		 214 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  76.53 
 
 		 214 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  76.06 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  75.59 
 
 		 214 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  74.65 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  75.59 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  76.06 
 
 		 213 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  73.24 
 
 		 213 aa  314  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  70.89 
 
 		 213 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  70.42 
 
 		 213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.76 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.76 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.76 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.28 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.28 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.28 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  50.5 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.28 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.03 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  49.03 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  51.2 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.24 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.24 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.24 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  49.52 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.5 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  49.27 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  49.27 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  49.27 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  44.34 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.59 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.23 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.42 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  43.98 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.09 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.5 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  44.44 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  41.98 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  45.24 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  44.29 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  43.19 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  43.19 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.26 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  43.46 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.69 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  39.82 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  45.45 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  41.35 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.91 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  41.86 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  36.36 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  36.36 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  35.89 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  44.17 
 
 		 301 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  41.8 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  41.31 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.2 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  37.96 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  42.51 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  42.38 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  42.51 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  37.86 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  43.85 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  43.48 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  45.05 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  35.82 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  39.61 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  39.61 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  33 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  31.28 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  33.18 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  39.87 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  32.06 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.2 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  30.92 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  32.54 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00870  endoplasmic reticulum protein, putative  38.1 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  34.39 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.16 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0031  hypothetical protein  39.91 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43918  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.7 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  36.09 
 
 		 233 aa  89.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>