89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1706 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
234 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.04 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0355329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  31.3 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  31.29 
 
 
297 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28.75 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  32.35 
 
 
357 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  27.71 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  27.92 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  32.53 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  31.58 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  27.9 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.17 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.17 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  29.01 
 
 
294 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.17 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.17 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  31.36 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  31.71 
 
 
340 aa  51.6  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.65 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.35 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.75 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
292 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.01 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  24.49 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  31.65 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  31.65 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  26.4 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  25.6 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  31.65 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
294 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  26.12 
 
 
341 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  26.74 
 
 
381 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
296 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  31.49 
 
 
301 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  28.39 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
329 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  24.37 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  29.11 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
294 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  29.83 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  29.83 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  32.62 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.25 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  27.97 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  29.11 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
295 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  28.69 
 
 
214 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  28.63 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
381 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  35.9 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  33.94 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.74 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  29.22 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0265  hypothetical protein  25.86 
 
 
440 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  26.95 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  27.14 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  30.39 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.257288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  31.47 
 
 
334 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  26.2 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
298 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.25 
 
 
209 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  44.9 
 
 
279 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
306 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
290 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.41 
 
 
340 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
318 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  27.2 
 
 
332 aa  42  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
296 aa  41.6  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>