119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0358 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  92.63 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.81 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  54.81 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.3 
 
 		 214 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  58.45 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.29 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.81 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.81 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.81 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.81 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.81 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.77 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.77 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.77 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.77 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.33 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.77 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  55.77 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  55.77 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  55.77 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  52.15 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  51.43 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  51.67 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  49.52 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  48.8 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  48.8 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  48.33 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  43.54 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  39.46 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  40.98 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.68 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  41.95 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  39.35 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  40.66 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  37.56 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  35.98 
 
 		 249 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  33.65 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  34.69 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  35.51 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  35.98 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.48 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.56 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  35.02 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  35.02 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  39.11 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  35.05 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  30.28 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.65 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.02 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.05 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  36.97 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  33.49 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.2 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  31.78 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  33.66 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.29 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  37.28 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 		 250 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  33.03 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  39.04 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.82 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  31.17 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  31.17 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.04 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  30.37 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.14 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  30.73 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00870  endoplasmic reticulum protein, putative  31.11 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  34.78 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  32.75 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43918  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  29 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0031  hypothetical protein  32.49 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  27.91 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  27.83 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>