131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4022 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4022  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3703  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3569  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  61.35 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3526  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.52 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3563  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.52 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3457  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.52 
 
 
211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3623  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.52 
 
 
211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3455  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.52 
 
 
211 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3620  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.11 
 
 
211 aa  228  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  55.77 
 
 
217 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3447  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.11 
 
 
211 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4471  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.11 
 
 
211 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.62 
 
 
211 aa  227  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  53.62 
 
 
211 aa  227  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.62 
 
 
211 aa  227  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3634  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.11 
 
 
211 aa  227  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  54.81 
 
 
217 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03019  predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.14 
 
 
211 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02970  hypothetical protein  53.14 
 
 
211 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.79 
 
 
214 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.27 
 
 
213 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  48.04 
 
 
213 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  47.06 
 
 
214 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  47.55 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  46.57 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  46.08 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  46.08 
 
 
213 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  48.04 
 
 
213 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  46.34 
 
 
213 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  49.46 
 
 
213 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  42.44 
 
 
213 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  41.04 
 
 
210 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  43 
 
 
224 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  40.37 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.2 
 
 
222 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.28 
 
 
222 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  40.09 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  40.09 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  39.53 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  40.09 
 
 
209 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  41.46 
 
 
219 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  41.78 
 
 
249 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  41.78 
 
 
209 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.31 
 
 
225 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  41.31 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.09 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  38.66 
 
 
209 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  39.63 
 
 
222 aa  121  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  42.65 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  40.47 
 
 
227 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  39.91 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  34.12 
 
 
219 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  34.12 
 
 
219 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  37.16 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  35.94 
 
 
222 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  36.74 
 
 
209 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.68 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
219 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.58 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  31.41 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.62 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
226 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0672  NADH dehydrogenase  37.75 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1901  oxidoreductase htatip2  32.37 
 
 
213 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0245456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003694  NAD(P)-binding protein  32.42 
 
 
229 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.47 
 
 
226 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02123  hypothetical protein  31.7 
 
 
231 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.36 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  40.4 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  37.71 
 
 
228 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  32.8 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2944  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.05 
 
 
240 aa  91.3  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43918  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  31.63 
 
 
233 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  31.82 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00783  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.48 
 
 
165 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.842186  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  32.31 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  31.95 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46234  predicted protein  30.81 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00870  endoplasmic reticulum protein, putative  28.77 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  32.16 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  31.25 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  22.7 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  29.24 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>